Hong, X., K. Wang, L.-Q. Ji, X. Liu, L. Yu, J. Wie, Y. Wang, C. Wie, W. Li & X.-P. Zhu (2023): Exploring the relationship between environmental DNA concentration and biomass in Asian giant softshell turtle (Pelochelys cantorii). – PeerJ 11(11): e16218.
Die Untersuchung der Beziehung zwischen der Konzentration der gemessenen Umwelt-DNS und der vorhandenen Biomasse für die asiatische Riesen-Weichschildkröte (Pelochelys cantorii).
Pelochelys cantorii,
© Ayushi Jain
In jüngster Zeit hat sich die sogenannte Umwelt-DNS-(eDNS)-Technologie zu einem akzeptierten Nachweisverfahren entwickelt, um damit seltene und bedrohte Spezies zu lokalisieren, denn dieses Verfahren hat eine gute ökonomische Effizienz, eine hohe Sensitivität und es ist nicht invasiv. Die asiatische Riesen-Weichschildkröte (Pelochelys cantorii) ist eine hochgradig geschützte aquatische Schildkröte in China und die traditionellen Erfassungsmethoden konnten bislang über viele Jahre keine natürlichen Populationen ausfindig machen. In dieser Studie entwickelten wir Primer und eine TaqMan-Probe, die ND5-DNS detektiert. Die Reaktionsbedingungen wurden anschließend optimiert und es wurde eine Standardkurve anhand von synthetischer DNS erstellt und es wurde eine eDNS-quantitative PCR (qPCR) Nachweismethode etabliert. Diese eDNS-Nachweismethode für P. cantorii zeigte, dass die Anzahl der Individuen, die sich in den experimentellen Teichen befanden, eine signifikante lineare Beziehung zu der eDNS-Konzentration aufwies (p < 0,05). Die eDNS-Konzentration zeigte eine negative Korrelation mit der Länge der Zeit, die verstrichen war, nachdem die P. cantorii aus dem Teich entfernt worden waren während der vergangenen 9 Tage. Die qPCR-Nachweismethode für P. cantorii eDNS die in dieser Studie entwickelt wurde kann für den qualitativen Nachweis von P. cantorii in Gewässern eingsetzt werden und sie kann auch für eine erste Evaluation der vorhanden relativen Biomasse genutzt werden. Das kann dazu beitragen, grundlegende Untersuchungen zum Nachweis der natürlichen Populationen von P. cantorii durchzuführen und sie kann dabei helfen, die Versuche zur Wiederansiedlung der Art in der Wildnis zu evaluieren.
Kommentar von H.-J. Bidmon
Sicher handelt es sich hier um eine gute Studie, die klar die Möglichkeiten aufzeigt, wie man auch für andere Arten solche Erfassungsmaßnahmen anhand von eDNS-Nachweisen durchführen kann. Dennoch kann ich mir vorstellen, dass es nicht leicht ist solche Flussschildkröten zu lokalisieren, denn die können auch wandern und auch die Fließgeschwindigkeit in den Gewässerabschnitten können die Ergebnisse mitbeeinflussen. Insofern würde ich meinen, dass man schon eine gewisse Vorstellung von den Verhaltens- und Lebensweisen dieser Art haben muss, um auch mit einer solchen Methode erfolgreich zusein. Siehe dazu auch Kirtane et al., (2019) und den dortigen Kommentar.
Literatur
Kirtane, A. A., M. L. Wilder & H. C. Green (2019): Development and validation of rapid environmental DNA (eDNA) detection methods for bog turtle (Glyptemys muhlenbergii). – PLoS One 14(11): e0222883 oder Abstract-Archiv.
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Pelochelys cantorii – Cantors Riesen-Weichschildkröte